曲靖三九中医院作为一家综合性中医院，其组织结构体现了中医特色与现代医院管理的结合。以下是其组织架构的概述：

一、党政管理机构

1. 党委系统

   • 党委办公室、纪委等，负责党建和党风廉政工作。

2. 行政系统

   • 院长/副院长：统筹全院运营。

   • 院办公室：综合协调。

   • 医务科：医疗质量、医政管理。

   • 护理部：全院护理工作。

   • 人力资源科：人事管理。

   • 财务科：预算与收支管理。

二、临床与医技科室

1. 中医内科

   • 心血管内科、呼吸内科、消化内科等。

2. 中医外科

   • 普通外科、骨科、肛肠科等。

3. 特色科室

   • 针灸科、推拿科、康复科等。

4. 医技科室

   • 检验科、放射科、B超室等。

三、科研与教学

• 科研科：中医药研究、学术交流。

• 教学科：实习生、进修生管理。

四、支撑保障部门

• 药剂科：中药房、西药房管理。

• 后勤科：物资供应、设备维护。

• 保卫科：安全管理。