16岁月经呈现褐色可能是由多种因素引起的，包括生理性和病理性的原因。以下是可能的原因和建议：

一、生理性原因

1. 月经初期或结束阶段

   • 月经开始或结束时，经血量较少，血液在阴道内停留时间较长，氧化后颜色可能变深，呈现褐色，这通常是正常的。

2. 激素水平波动

   • 青春期激素水平不稳定可能导致月经颜色和量的变化。

二、病理性原因

1. 内分泌失调

   • 如多囊卵巢综合征（PCOS）、甲状腺功能异常等，可能导致月经不规律和颜色变化。

2. 感染或炎症

   • 如盆腔炎、阴道炎等，可能伴有异味、瘙痒等症状。

3. 其他原因

   • 如子宫内膜异位症、子宫肌瘤等，但这类情况在青少年中较为少见。

三、建议

1. 观察：如果偶尔出现且无其他不适，可以先观察，记录月经周期和症状。

2. 就医检查：如果褐色月经持续多个周期，或伴有疼痛、异味、瘙痒等症状，建议及时就医，进行妇科检查和必要的实验室检测。

3. 保持卫生：注意个人卫生，避免使用刺激性强的清洁产品。

4. 健康生活方式：保持规律作息，均衡饮食，适量运动，有助于调节激素水平。