小袋纤毛虫病的治疗费用因地区、医院等级、治疗方案及患者具体情况而异，以下为大致费用范围及影响因素：

1. 诊断费用

• 粪便检查：约50-200元（显微镜检查虫卵或包囊）。

• PCR检测（如需）：300-800元（更精准的分子生物学检测）。

2. 治疗药物费用

• 甲硝唑（首选药物）：约20-100元/疗程（剂量和疗程长短影响价格）。

• 替硝唑/奥硝唑（替代药物）：50-200元/疗程。

• 中药辅助治疗（如苦参汤）：约100-300元。

3. 其他可能费用

• 复查费用：治疗后需复查粪便，约50-200元。

• 并发症处理（如肠炎、脱水）：额外500-2000元不等。

4. 总费用估算

普通病例总费用通常在200-1000元之间，若需住院或出现并发症，费用可能增至2000-5000元。

5. 医保报销

部分基础药物（如甲硝唑）和检查项目可医保报销，报销比例因地而异（通常50%-70%）。

建议到当地医院感染科或寄生虫病专科咨询具体方案及费用，并携带医保卡以享受报销政策。