慢性进行性眼外肌麻痹（CPEO）的治疗费用因治疗方案、地区、医院等级以及患者具体情况而异。以下是费用相关的主要因素：

1. 诊断费用

• 初步检查：包括眼科检查、血液检测、影像学检查（如MRI或CT）等，费用约为1000-5000元。

• 基因检测：如需确诊线粒体疾病，费用可能在3000-10000元。

2. 治疗费用

• 药物治疗：如辅酶Q10、维生素等，每月费用约为200-1000元。

• 手术治疗：如眼肌手术，费用可能在10000-50000元，具体取决于手术复杂程度和医院等级。

• 康复治疗：如物理治疗、视觉训练等，费用约为500-3000元/月。

3. 其他费用

• 随访检查：定期复查费用约为500-2000元/次。

• 辅助设备：如特殊眼镜、遮光镜等，费用约为500-3000元。

4. 医保报销

部分检查和治疗可能纳入医保报销范围，具体比例和条件需咨询当地医保部门。

总体而言，慢性进行性眼外肌麻痹的治疗费用可能在每年5000-50000元不等，具体需根据患者病情和治疗方案确定。建议尽早到专业医院就诊，制定个性化治疗计划。